Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OptnQ8K3K8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms