Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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