Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trappc12Q8K2L8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc12Q8K2L8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms