Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms