Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm9955Q8CEJ8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Gm9955Q8CEJ8 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Adamtsl3-203ENSMUST00000173287 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm9955Q8CEJ8 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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