Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc38Q8CDN8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc38Q8CDN8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc38Q8CDN8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc38Q8CDN8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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