Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms