Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4D8

Gm11541, Predicted gene 11541, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11541Q8C4D8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm11541Q8C4D8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm11541Q8C4D8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm11541Q8C4D8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm11541Q8C4D8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm11541Q8C4D8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm11541Q8C4D8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms