Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ctdsp2Q8BX07 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ctdsp2Q8BX07 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ctdsp2Q8BX07 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ctdsp2Q8BX07 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ctdsp2Q8BX07 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctdsp2Q8BX07 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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