Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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