Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms