Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ubash3bQ8BGG7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ubash3bQ8BGG7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ubash3bQ8BGG7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ubash3bQ8BGG7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ubash3bQ8BGG7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Ubash3bQ8BGG7 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Ubash3bQ8BGG7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ubash3bQ8BGG7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 935.9 ms