Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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