Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms