Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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