Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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Pcsk9Q80W65 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Pcsk9Q80W65 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Pcsk9Q80W65 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Pcsk9Q80W65 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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Pcsk9Q80W65 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Pcsk9Q80W65 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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