Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Dsg1bQ7TSF1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Dsg1bQ7TSF1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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