Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms