Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms