Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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