Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms