Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VcanQ62059 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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VcanQ62059 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VcanQ62059 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VcanQ62059 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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