Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rai1Q61818 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms