Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms