Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Tdrd5Q5VCS6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Tdrd5Q5VCS6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tdrd5Q5VCS6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tdrd5Q5VCS6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tdrd5Q5VCS6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tdrd5Q5VCS6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tdrd5Q5VCS6 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tdrd5Q5VCS6 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tdrd5Q5VCS6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms