Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbs12Q5SUD9 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms