Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms