Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Trim58Q5NCC9 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Trim58Q5NCC9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Trim58Q5NCC9 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Trim58Q5NCC9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Trim58Q5NCC9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Trim58Q5NCC9 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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