Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl5Q5DTT4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms