Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp48Q3V0C5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp48Q3V0C5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp48Q3V0C5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp48Q3V0C5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp48Q3V0C5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp48Q3V0C5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp48Q3V0C5 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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