Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms