Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms