Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fchsd2Q3USJ8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fchsd2Q3USJ8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms