Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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