Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms