Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Skap2Q3UND0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms