Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp19Q3UJD6 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms