Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms