Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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