Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccndbp1Q3TVC7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccndbp1Q3TVC7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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