Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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