Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fndc4Q3TR08 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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