Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms