Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Samd12Q0VE29 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms