Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms