Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Dtymk-203ENSMUST00000112893 1040 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrriq1Q0P5X1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms