Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms