Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Sh3bp2Q06649 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Sh3bp2Q06649 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Sh3bp2Q06649 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Sh3bp2Q06649 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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