Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms