Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms